为你 生物体中的转录本,无论是编码还是非编码。
同样,您需要分离生物体的整个RNA。为您实现 这,而不是使用诸如信使RNA的分数,您可以选择总 RNA。这包括细胞中的所有RNA和其他不同的RNA,而不仅仅是 信使RNA或mRNA。科学家现在正在深入研究RNA生物学 和转录组。通过这种技术,他们可以轻松地测量基因和转录本的丰度,同时识别转录组的已知新特征。 大多数总RNA是通过多种途径从各种细胞和组织获得的 方法学被称为修饰的硫氰酸胍。
是什么使总数 RNA desirable?
即使你是 处理低质量或正常样品时,总RNA测序可为您提供 具有最佳覆盖范围。这意味着您可以对基因组结果的功能充满信心。这遵循了对复杂性的现代理解 RNA的转录同样,RNA的功能也发生了变化 极大地。这就是为什么您必须考虑所有可用的RNA种类的原因 有机体或组织。
对每个样品使用理想的方案或试剂盒有助于 确保完全回收高质量RNA,非常适合代表 研究中的低拷贝序列。您可以获得数千个此类样本 从不同的人体组织(包括正常,肿瘤或组织)获得 表现出其他疾病。
通过使用 已经获得的样本 总RNA,您可以节省时间和精力 您的研究。从不同位置定位和提取RNA的麻烦 样本可能很耗时。它们中的大多数已准备好用于cDNA 合成,Northern印迹,RNase保护分析,qrt-PCR,microRNA 研究和RNA差异展示等。 此外,它还允许您在广泛的动态范围内识别所有生物标记。 transcripts.
您还可以全面了解自己感兴趣的所有表型 在您的研究中。您也可以轻松进行分析。再次,因为 去除了丰富的RNA种类,使感兴趣的转录本完整无损 和碎片化,从而最大程度地捕获库。
共同特征 of 总RNA
- 通过广泛的质量控制 流程以确保它们具有最高质量。确认 RNA的完整性,通过目测检查以检查是否存在 18s和28s核糖体RNA的完整性和存在性。分光光度计也可用于检查质量和纯度。它也用DNAse I处理。
- 它们是从各种组织中分离出来的,其中一些很难获得。
- 多糖去污;
- 高效逆转录;
- 有适当的组织临床记录文件。
的区域 application
由于其 合乎需要的是,总RNA已被用于各个领域的研究中。 基因等临床研究。如果您想:
- 分析拼接和替代拼接工具;
- 如果您想获得整个转录组的全基因组视图;
- 深入研究人类和非人类起源的转录组;
- Northern印迹,RACE和RT-PCR;
- cDNA文库的构建和合成;
- 进行基因表达研究的理想cDNA研究;
- 核糖核酸引物的延伸和保护;
- mRNA纯化程序;
- microRNA的研究;
- 显示RNA等。
如何 与其他测序策略不同?
这种方法 允许编码和非编码RNA测序,使其与 其他转录组测序方法。而不是接受polyA + 选择时,该技术会使整个RNA消耗rRNA。这是因为rRNA占整个RNA的最大百分比。
减少rRNA的过程对于将更多其他测序读数分配给您感兴趣的转录本至关重要。你可以用 如果要分析生物体的所有RNA转录本。它 使您能够探索所有可用的RNA种类,而与允许 您分析基因组的特定编码部分。
您可以在任何位置发现一些新的变体和替代的剪接 感兴趣的基因组。它还可以让您了解影响 肿瘤的分类和进展。此外,如果您正在工作 与具有大而重复的基因组的生物(例如植物)一起, 技术使您轻松对其进行排序。
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